目前已有125個植物物種基因組發表,150個動物物種基因組發表。詳細信息下列表:
中文名 | 拉丁名 | 科、屬 | 刊物 | 發表時間 | 基因組大小 | 組裝情況scaffold(N50) |
黑芥 | Brassica nigra | 十字花科蕓薹屬 | Nature genetics | 2016.09 | 396.9Mb | 557.3kb |
芥菜 | Brassica juncea | 十字花科蕓薹屬 | Nature genetics | 2016.09 | 402.1Mb, 547.5Mb | 1.5Mb |
南半球海草 | Zostera muelleri | 大葉藻科、大葉藻屬 | Plant Physiology | 2016.07 | 632 Mb | 36.732Mb |
油橄欖 | Olea europaea subsp. europaea | 木犀科、木犀屬 | GigaScience | 2016.06 | 1.31Gb | 443kb |
橡膠樹 | Hevea brasiliensis | 大戟科、橡膠樹屬? | Scientific Reports | 2016.06 | 1.55Gb | 67.24kb |
橡膠樹 | Hevea brasiliensis | 大戟科、橡膠樹屬? | Nature Plants | 2016.05 | 1.37Gb | 1.28Mb |
瑪卡 | Lepidium meyenii | 十字花科、獨行菜屬 | Molecular Plant | 2016.05 | 743 Mb | 2.42Mb |
普通胡桃 | Juglans regia L. | 胡桃科、胡桃屬 | The Plant Journal | 2016.05 | 667Mb | 464,955bp |
胡蘿卜 | Daucus carota subsp. carota L. | 傘形科、胡蘿卜屬 | Nature Genetics | 2016.05 | 473Mb | 12.7Mb |
木薯 | Manihot esculenta | 大戟科、木薯屬 | Nature biotechnology | 2016.04 | 27.7kb | |
花生A基因組 | Arachis duranensis | 豆科、落花生屬 | PNAS | 2016.04 | 1.05Gb | 650kb |
丹參 | Salvia miltiorrhiza | 唇形科、鼠尾草屬 | Molecular Plant | 2016.03 | 538Mb | 51.02kb |
菜豆 | Phaseolus vulgaris L | 豆科、菜豆屬 | Genome Biology | 2016.03 | 549Mb | 526kb |
鐵皮石斛 | Dendrobium catenatum | 蘭科、石斛屬 | Scientific Reports | 2016.02 | 1.01 Gb | 391kb |
蔓花生 | Arachis duranensis; A.ipaensis | 豆科、落花生屬 | Nature Genetics | 2016.02 | 1.25Gb, 1.56 Gb | 947kb, 5.3Mb |
大葉藻 | Zostera marina | 澤瀉目、大葉藻科 | Nature | 2016.01 | 202.3Mb | 485,578bp |
復活草 | Oropetium thomaeum | 鼠尾草亞科 | Nature | 2015.11 | 245Mb | 2.4Mb |
紅花苜蓿 | Trifolium pratense L. | 豆科、苜蓿屬 | Scientific Reports | 2015.11 | 420 Mb | 223kb |
甲藻 | Symbiodinium kawagutii | 蟲黃藻,甲藻門 | Science | 2015.11 | ||
菠蘿 | Ananas comosus | 鳳梨科、鳳梨屬 | Nature Genetics | 2015.11 | 526Mb | 11.8Mb |
小豆 | Vigna angularis | 豆科、豇豆屬 | PNAS | 2015.1 | 466.7Mb | 1.29Mb |
鐵皮石斛 | Dendrobium officinale Kimura et Migo | 蘭科、石斛屬 | Molecular Plant | 2015.06 | 1.35Gb | 76.4Kb |
牛耳草 | Boea hygrometrica | 苦苣苔科、旋蒴苣苔屬 | PNAS | 2015.04 | 1.69Gb | 110Kb |
海帶 | Saccharina japonica | 海帶科、海帶屬 | Nature Communications | 2015.04 | 537Mb | 252Kb |
陸地棉(南京農大) | Gossypium hirsutum TM-1 | 錦葵科、棉屬 | Nature biotechnology | 2015.04 | 2.43Gb | 1.6Mb |
陸地棉(中科院) | Gossypium hirsutum TM-1 | 錦葵科、棉屬 | Nature biotechnology | 2015.04 | 2.43Gb | 764 kb |
麻瘋樹 | Jatropha curcas L. | 大戟科、麻瘋樹屬 | The Plant Journal | 2015.03 | 320.5Mb | 746 Kb |
報春花 | Primula veris | 報春花科、報春花屬 | Genome Biology | 2015.01 | 479Mb | 164kb |
青稞 | Lasa Goumang | 禾本科、大麥屬 | PNAS | 2015.01 | 4.5Gb | 242 kb |
蘭花 | Phalaenopsis equestris | 蘭科、蝴蝶蘭屬 | Nature Genetics | 2014.11 | 1.16Gb | 359kb |
五種純合稻 | Oryza | 禾本科、稻屬 | PNAS | 2014.1 | 366-395Mb | 118-772kb |
棗 | Ziziphus jujuba Mill. | 鼠李科、棗屬 | Nature Communications | 2014.1 | 444Mb | 301kb |
大豆(泛基因組) | Glycine soja | 豆科、大豆屬 | Nature Biotechnology | 2014.1 | 889Mb-1118Mb | 17-65.1kb |
咖啡 | Coffea canephora | 茜草科、咖啡屬 | Science | 2014.09 | 710Mb | 1.3 Mb |
甘藍型油菜 | Brassica napus | 十字花科、蕓薹科 | Science | 2014.08 | 1130Mb | 777kb |
野生大豆 | Glycine max | 豆科、大豆屬 | Nature Communications | 2014.07 | 1.17Gb | 43.8Kb-401.3 kb |
野生番茄 | Solanum pennellii? | 茄科、茄屬 | Nature Communications | 2014.07 | 1.2Gb | 16 Mb |
小麥B | Triticum aestivum | 禾本科、小麥屬 | Science | 2014.07 | 6.274Gb | 2752bp |
非洲稻 | Oryza glaberrima | 禾本科、稻屬 | Nature Genetics | 2014.07 | 316 Mb | 217 kb |
栽培柑橘科植物 | Cultivated citrus | 蕓香科、柑橘屬 | Nature Biotechnology | 2014.06 | 301.4 Mb | 6.8Mb |
巨桉樹 | Eucalyptus grandis | 桃金娘科、桉屬 | Nature | 2014.06 | 640 Mb | 53.9Mb |
甘藍 | Brassica oleracea | 十字花科、蕓薹屬 | Nature Communications | 2014.05 | 630Mb | 259Kb-1457kb |
煙草 | Nicotiana tabacum | 茄科、煙草屬 | Nature Communications | 2014.05 | 4.41Gb-4.60Gb | 345kb-386kb |
樹棉 | Gossypium arboretum | 錦葵科、棉屬 | Nature Genetics | 2014.05 | 1.75Gb | 666 kb |
火炬松 | Pinus taeda | 松科、松屬 | Genome Biology/Genetics | 2014.03 | 22 Gb | 66.9 kb |
芝麻 | Sesamum indicum L. | 唇形目 | Genome Biology | 2014.03 | 274 Mb | 2.1 Mb |
辣椒 | C.annuum L. | 辣椒屬 | PNAS | 2014.03 | 3.35 Gb, 3.48 Gb | 445 kb-1.23 Mb |
浮萍 | Spirodela polyrhiza | 浮萍科 | Nature Communications | 2014.02 | 158 Mb | 3.76 Mb |
辣椒 | Capsicum annuum | 茄科、辣椒屬 | Nature Genetics | 2014.01 | 3.48 Gb, 3.14 Gb | 60.3 kb-2.47 Mb |
甜菜 | Beta vulgaris ssp. vulgaris | 藜科、甜菜屬 | Nature | 2013.12 | 731 Mb | 2.01 Mb |
無油樟 | Amborella trichopoda | 無油樟科、無油樟屬 | Science | 2013.12 | 748 Mb | 4.9 Mb |
康乃馨 | Dianthus caryophyllusL. | 石竹科、石竹屬 | DNA Res. | 2013.12 | 622 Mb | 60.7kb |
栽培草莓 | Fragaria x ananassa | 薔薇科、草莓屬 | DNA Res. | 2013.11 | 692 Mb | 5.1kb |
胡楊 | Populus euphratica | 楊柳科、楊屬? | Nature Communications | 2013.11 | 593 Mb | 482kb |
獼猴桃 | Actinidia chinensis | 獼猴桃科、獼猴桃屬 | Nature Communications | 2013.1 | 758 Mb | 646.8kb |
桑樹 | Morus notabilis | 桑科、桑屬 | Nature Communications | 2013.09 | 357 Mb | 390kb |
蓮 | Nelumbo nucifera | 睡蓮科、蓮屬 | Plant Journal | 2013.08 | 879 Mb | 986.5kb |
醉蝶花 | Tarenaya hassleriana | 醉蝶花科、醉蝶花屬 | Plant Cell | 2013.08 | 290 Mb | 551.9kb |
棗椰樹 | Phoenix dactylifera L. | 棕櫚科、刺葵屬 | Nature Communications | 2013.08 | 671 Mb | 329.9kb |
油棕櫚 | Elaeis guineensis | 棕櫚科、油棕櫚屬 | Nature | 2013.07 | 1.8G | 1.27Mb |
蟲黃藻 | Symbiodinium minutum | 甲藻門 | Current Biology | 2013.07 | 1.5G | 126.2kb |
矮樺 | Betula nana | 樺樹科、樺樹屬 | Molecular Ecology | 2013.06 | 450 Mb | 18.6kb |
海洋球石藻 | Emiliania huxleyi | 定鞭藻綱 | Nature | 2013.06 | 141.7Mb | 404.8kb |
挪威云杉 | Picea abies | 松科、云杉屬 | Nature | 2013.05 | 19.6G | |
中國蓮 | Nelumbo nucifera Gaertn | 睡蓮科、蓮屬 | Genome biology | 2013.05 | 929 Mb | 3.4 Mb |
絲葉貍藻 | Utricularia gibba | 貍藻科、貍藻屬 | Nature | 2013.05 | 82Mb | 97.6kb |
桃樹 | Prunus persica | 薔薇科、梨屬 | Nature Genetics | 2013.03 | 265 Mb | 4 Mb |
小麥D | Aegilops tauschii | 禾本科、小麥屬 | Nature | 2013.03 | 4.36Gb | 57.6kb |
小麥A | Triticum urartu | 禾本科、小麥屬 | Nature | 2013.03 | 4.94 Gb | 63.69 kb |
短花藥野生稻 | Oryza brachyantha | 禾本科稻屬 | Nature Communications | 2013.03 | 342Mb-362Mb | 1.6Mb |
毛竹 | Phyllostachys heterocycla | 竹科、鋼竹屬 | Nature Genetics | 2013.02 | 2.075 Gb | 328,698 bp |
橡膠樹 | Hevea brasiliensis | 大戟科、橡膠樹屬? | BMC Genomics | 2013.02 | 2.15Gb | 2.972 kb |
鷹嘴豆 | Cicer arietinum | 豆科、鷹嘴豆屬 | Nature biotechnology | 2013.01 | 738Mb | 39.99Mb |
梅花 | Prunus mume | 薔薇科、梨屬 | Nature Communications | 2012.12 | 280M | 1.1Mb |
棉花 | Gossypium raimondii | 錦葵科、棉屬 | Nature | 2012.12 | 761.4Mb | 62.2Mb |
兩種小型藻 | Bigelowiella natans; Guillardia theta | Nature | 2012.11 | 95Mb 87Mb | 545.8 kb-820 kb | |
小麥 | Triticum aestivum | 禾本科、小麥屬 | Nature | 2012.11 | 17Gb | |
甜橙 | Citrus sinensis | 蕓香科、柑橘屬 | Nature Genetics | 2012.11 | 367 Mb | 1.69Mb |
西瓜 | Citrullus lanatus | 葫蘆科、西瓜屬 | Nature Genetics | 2012.11 | 425 Mb | 2.38Mb |
梨 | Pyrus bretschneideri | 薔薇科、梨屬 | Genome Research | 2012.11 | 527Mb | 540.8 kb |
大麥 | Hordeum vulgare L. | 禾本科、大麥屬 | Nature | 2012.1 | 5.1Gb | |
雷蒙德氏棉 | Gossypium raimondii | 錦葵科、棉屬 | Nature Genetics | 2012.08 | 775.2Mb | 2.28Mb |
香蕉 | Musa acuminata | 芭蕉科、芭蕉屬 | Nature | 2012.07 | 523Mb | 1.3 Mb |
鹽芥 | Thellungiella salsuginea | 十字花科、鹽芥屬 | PNAS | 2012.07 | 260Mb | 403.5kb |
亞麻 | Linum usitatissimum | 亞麻科、亞麻屬 | Plant Journal | 2012.07 | 373Mb | 694kb |
甜瓜 | Cucumis melo L. | 葫蘆科、甜瓜屬 | PNAS | 2012.07 | 450Mb | 4.68 Mb |
番茄 | Solanum lycopersicum | 茄科、茄屬 | Nature | 2012.05 | 900Mb | 4.45 Mb |
谷子 | Setaria italica | 禾本科、狗尾草屬 | Nature biotechnology | 2012.05 | 500M | 47.3 Mb |
谷子 | Setaria italica | 禾本科、狗尾草屬 | Nature biotechnology | 2012.05 | 490M | 1.0 Mb |
藍載藻(灰胞藻門) | Cyanophora paradoxa | 灰胞藻門 | Science | 2012.02 | 70M | |
蒺藜苜蓿 | Medicago truncatula | 豆科苜蓿屬 | Nature | 2011.11 | 500M | |
木豆 | Cajanus cajan | 豆科、木豆屬 | Nature biotechnology | 2011.11 | 833M | 516Kb |
印度大麻 | Cannabis sativa | 大麻屬 | Genome biology | 2011.1 | 534M | 16.2Kb |
白菜 | Brassica rapa | 十字花科、蕓薹屬 | Nature Genetics | 2011.08 | 485M | 1.97Mb |
條葉藍芥 | Thellugiella parvula | 鹽芥屬 | Nature Genetics | 2011.08 | 140M | 5.296Mb |
馬鈴薯 | Solanum tuberosum | 茄目、茄科、茄屬 | Nature | 2011.07 | 844M | 386.6K |
琴葉擬南芥 | Arabidopsis lyrata | 十字花科、鼠耳芥屬 | Nature Genetics | 2011.05 | 206.7 Mb | 4M |
棗椰樹 | Phoenix dactylifera | 棕櫚科 | Nature biotechnology | 2011.05 | 685M | 30.5kb |
卷柏 | Selaginella moellendorffii | 卷柏屬 | Science | 2011.05 | 212M | 1.7Mb |
麻風樹 | Jatropha curcas L. | 大戟科、麻風樹屬 | DNA Res. | 2010.12 | 410M | |
褐潮藻類 | Aureococcus anophagefferens | PNAS | 2011.02 | 57M | 1.3 Mb | |
野生大豆 | G. soja | 豆科、大豆屬 | PNAS | 2010.12 | 915.4 Mb | |
可可樹 | Theobroma cacao | 梧桐科、可可屬 | Nature Genetics | 2010.12 | 430-Mb | 473.8 kb |
森林草莓 | Fragaria vesca | 薔薇科、草莓屬 | Nature Genetics | 2010.12 | 240M | 1.3 Mb |
蘋果 | Malus × domestica Borkh. | 薔薇科、蘋果屬 | Nature Genetics | 2010.09 | 742M | 1,542.7kb |
小球藻 | Chlorella variabilis NC64A | 小球藻科 | Plant Cell | 2010.09 | 46M | 1.5M |
蓖麻 | Ricinus communis | 大戟科、蓖麻屬 | Nature Biotechnology | 2010.08 | 350M | 496.5kb |
團藻 | Volvox carteri | 團藻屬 | Science | 2010.07 | 138M | 1.41Mb |
褐藻 | Ectocarpus | 水云屬? | Nature | 2010.06 | 196M | ?504,428bp |
二穗短柄草 | Brachypodium distachyon | 禾本科、短柄草屬 | Nature | 2010.02 | 260M | 59.3 Mb |
大豆 | Glycine max | 豆科、大豆屬 | Nature | 2010.01 | 1100M | 47.8 MB |
黃瓜 | Cucumis sativus L. | 葫蘆科、黃瓜屬 | Nature Genetics | 2009.11 | 350M | 1,140kb |
玉米 | Zea mays ssp. mays L. | 禾本科、玉米屬 | Science | 2009.11 | 2300M | 76 kb |
高粱 | Sorghum bicolor | 禾本科、高粱屬 | Nature | 2009.01 | 730M | 7.0 Mbp |
三角褐指藻 | Phaeodactylum tricornutum | 褐指藻屬 | Nature | 2008.11 | 27.4M | |
百脈根 | Lotus japonicus | 豆科 | DNA Res. | 2008.05 | 472 Mb | |
番木瓜 | Carica papaya | 番木瓜科、番木瓜屬 | Nature | 2008.04 | 370M | 1Mb |
小立碗蘚 | Physcomitrella pattens | 葫蘆蘚科、小立碗蘚屬 | Science | 2008.01 | 480M | 1.32 Mbp |
衣藻 | Chlamydomonas reinhardtii | 衣藻科、衣藻屬 | Science | 2007.01 | 130 M | 1.63 Mb |
葡萄 | Vitis vinifera | 葡萄科、葡萄屬 | Nature | 2007.09 | 490M | 2.07Mb |
楊樹 | Populus trichocarpa | 楊柳科、楊屬 | Science | 2006.09 | 480M | 3100kb |
水稻 | Oryza sativa L. ssp.japonica | 禾本科;稻屬 | Science | 2002.04 | 466M | |
水稻 | Oryza sativa L. ssp.indica | 禾本科;稻屬 | Science | 2002.04 | 466M | 11.76kb |
擬南芥 | Arabidopsis thaliana | 十字花科;鼠耳芥屬 | Nature | 2000.12 | 125M |